千代台公園陸上競技場をスタートし、津軽海峡に面する漁火通、電車（市電）通り、赤レンガ倉庫のあるベイエリア（フルのみ）などを、全国から集まったランナーが駆け抜けます。函館山や海、観光スポットを満喫できる「美しい街の、眺めのいいコース」として、人気の高い大会です。

また、函館らしい味が楽しめるフードエイドも話題。主なアイテムは、赤肉メロン、トラピスチヌ修道院のホワイトミルクチョコレート、ミニ五勝手屋羊羹（以上、フル・ハーフ共通）、漁り火がごめ丼（ミニ海鮮丼）、冷やし塩ラーメン、スナッフルスのチーズオムレット（以上フルのみ）など。

ボランティアスタッフによる給水や、沿道にずらりと並んだギャラリーの熱い声援が、ランナー達の力になります。観光の途中で応援するのも、思い出に残ることでしょう。

「函館ハーフマラソン大会」として歴史を重ねてきましたが、2016年からフルマラソン・ハーフマラソン同時開催の「函館マラソン」となりました。国内の大会では珍しい海沿いのロングコースと、近年のマラソンブームで、毎回8000人のランナーが集まります。