千代台公園陸上競技場をスタートし、津軽海峡に面する漁火通、電車（市電）通り、赤レンガ倉庫のあるベイエリア（フルのみ）などを、全国から集まったランナーが駆け抜けます。函館山や海、観光スポットを満喫できる「美しい街の、眺めのいいコース」として、人気の高い大会です。

また、函館らしい味が楽しめるフードエイドも話題。主なアイテムは、赤肉メロン、トラピスチヌ修道院のホワイトミルクチョコレート、ミニ五勝手屋羊かん（以上、フル・ハーフ共通）、漁り火がごめ丼とミニ海鮮丼、冷やし塩ラーメン、スナッフルスのチーズオムレット（以上フルのみ）など。

ボランティアスタッフによる補給や、沿道にずらりと並んだギャラリーの熱い声援が、ランナー達の力になります。観光の途中で応援するのも、思い出に残ることでしょう。一緒に応援したいかたは、こちらをご覧ください。

「函館ハーフマラソン大会」として歴史を重ねてきましたが、2016年からフルマラソン・ハーフマラソン同時開催の「函館マラソン」となりました。国内の大会では珍しい海沿いのロングコースと、近年のマラソンブームで、毎回8000人のランナーが集まります。2019年から北海道マラソン、サロマ湖100kmウルトラマラソンと並び、北海道3大マラソンの冠がつきました。また、フルマラソンの完走者には、新たに完走メダルが贈られます。

2019年のゲストは、横浜DeNAランニングクラブ総監督の瀬古利彦さん、はこだて観光大使でタレントの福島和可菜さん。招待選手は、MGC（東京オリンピック代表選考を兼ねた今秋のレース）ファイナリスト13名を含む22名。